Nostros trabajamos con electrónicas de AEM, pero mi consejo en tu caso es Hondata, tienes mapas por donde empezar, muchos de ellos según modificaciones que tenga el motor, el resto es ponerse las pilas, investigar, pedir ayuda a los que realmente saben tocar y lo tienes hecho.
Con la AEM o compras adaptadores de cableado que son muy caros, o te tocará hacer empalmes y no pocos, si no se tiene experiencia. Se programa de manera diferente a la mayoría, hay pocos que la tocan y es más para preparaciones complejas.
Hondata dependiendo del año tiene K-pro, flashpro o reflash, mi consejo es K-pro.
Puedes bajarte el soft gratis y trasteas con el, verás un montón de mapas para el S2000 con los cuales empezar a investigar.
KikeR de KDPerformance lo controla mucho y siempre te puede echar una mano.
Suerte.